Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pkhd1E9PZ36 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pkhd1E9PZ36 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms