Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srp54bE9PXC0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms