Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sfta2E9PXB6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms