Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI7

C87414, Expressed sequence C87414, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87414E9PWI7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C87414E9PWI7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms