Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms