Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clca3bE9PUL3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms