Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl3E0CZ16 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms