Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms