Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Fam46aD3Z5S8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Fam46aD3Z5S8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam46aD3Z5S8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Fam46aD3Z5S8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Fam46aD3Z5S8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Fam46aD3Z5S8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fam46aD3Z5S8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Fam46aD3Z5S8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Fam46aD3Z5S8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms