Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5934D3Z4U6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms