Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6685D3YYP3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms