Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf217D3YYI7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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