Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kif28pD3YXS5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms