Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms