Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim30cD3YVI9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim30cD3YVI9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim30cD3YVI9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim30cD3YVI9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30cD3YVI9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms