Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms