Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cspp1B2RX88 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cspp1B2RX88 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms