Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clrn2B2RVW2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clrn2B2RVW2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms