Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rd3lB2RV38 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rd3lB2RV38 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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