Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PtprbB2RU80 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PtprbB2RU80 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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