Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc2B2RR83 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms