Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Uhrf1bp1B2KF50 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Uhrf1bp1B2KF50 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms