Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms