Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb8B1AY40 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssxb8B1AY40 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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