Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms