Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms