Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a6B1AVK5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms