Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NhsB1AV60 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NhsB1AV60 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NhsB1AV60 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NhsB1AV60 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NhsB1AV60 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NhsB1AV60 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NhsB1AV60 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 469.3 ms