Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms