Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skint8A7XV07 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skint8A7XV07 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skint8A7XV07 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skint8A7XV07 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint8A7XV07 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint8A7XV07 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint8A7XV07 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint8A7XV07 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms