Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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H2-M5A7VMS3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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