Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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