Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Atp8b5A3FIN4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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Atp8b5A3FIN4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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