Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms