Protein–RNA interactions for Protein: A2AKQ8

Ttc30a2, Tetratricopeptide repeat protein 30A2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a2A2AKQ8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ttc30a2A2AKQ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc30a2A2AKQ8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc30a2A2AKQ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc30a2A2AKQ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc30a2A2AKQ8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a2A2AKQ8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ttc30a2A2AKQ8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms