Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Frmpd1A2AKB4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmpd1A2AKB4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmpd1A2AKB4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms