Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Camsap1A2AHC3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Camsap1A2AHC3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms