Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms