Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms