Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul4bA2A432 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul4bA2A432 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul4bA2A432 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul4bA2A432 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul4bA2A432 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul4bA2A432 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul4bA2A432 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms