Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Trav12-2A0N8N6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trav12-2A0N8N6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trav12-2A0N8N6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trav12-2A0N8N6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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