Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms