Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPC5

Zfp109, Zinc finger protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp109A0A0U1RPC5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp109A0A0U1RPC5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms