Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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