Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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