Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc166S4R181 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc166S4R181 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms