Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Homer1Q9Z2Y3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms