Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Robo3Q9Z2I4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Robo3Q9Z2I4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms