Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd4Q9Z2D7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd4Q9Z2D7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms