Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cldn7Q9Z261 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn7Q9Z261 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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